Mekatilili được sinh ra vào những năm 1860 tại Mutsara wa Tsatsu ở Bamba, huyện Kilifi. Bà là con gái duy nhất trong một gia đình có năm người con. Một trong những anh trai của bà, Mwarandu, đã bị nô lệ Ả Rập bắt giữ và không bao giờ gặp lại.[1] Bà đã kết hôn với Dyeka tại Lango Baya.